Trước đó, ngày 30/9, tại Khoa Ung bướu tầng 8, nhà D Bệnh viện Việt Đức, qua xét nghiệm sàng lọc phát hiện 1 người nhà người bệnh dương tính với virus SARS-CoV-2. 

Ngay sau khi phát hiện, bệnh viện đã phong tỏa tòa nhà D  và kích hoạt phương án phòng chống dịch khẩn cấp, thực hiện xét nghiệm toàn bộ người có mặt trong bệnh viện. Kết quả, ngày 1/10 phát hiện 18 trường hợp dương tính tập trung tại tầng 7 nhà D, và 1 trường hợp nhân viên nhà ăn. Bệnh viện phong tỏa chặt tầng 7, tầng 8 nhà D và tiến hành truy vết các trường hợp liên quan. Tổng số đã ghi nhận 34 trường hợp F0 là những người lây nhiễm trong bệnh viện. Trong 34 ca mắc ghi nhận, không có trường hợp nào tử vong do Covid-19.

Ngay sau đó, bệnh viện tạm dừng hoạt động khám bệnh bình thường. Chỉ tiếp nhận người bệnh cấp cứu, mổ cấp cứu, và chạy thận chu kỳ cho một số người bệnh suy thận. Thực hiện cách ly y tế. Phân luồng đường đi trong khuôn viên bệnh viện, phân luồng thu gom chất thải, đồ vải bẩn và cung cấp vật tư tiêu hao cho khu vực cách ly và bệnh viện.

 Từ ngày 5/10 đến ngày 8/10, bệnh viện đã chuyển 881 người bệnh và 802 người nhà người bệnh đến 6 bệnh viện (Bệnh viện điều trị người bệnh Covid-19 Y Hà Nội, Bệnh viện Đa khoa Đức Giang, Bệnh viện Đa khoa Hà Đông, Bệnh viện Thanh Nhàn, Bệnh viện E, Bệnh viện Nhi Trung ương) để cách ly, theo dõi điều trị. Tất cả số người bệnh, người nhà người bệnh này đều được xét nghiệm RT-PCR 2 lần âm tính trước khi chuyển và bố trí phương tiện vận chuyển thực hiện đúng quy định.

Cho đến ngày 14/10, trong toàn bệnh viện ngoại trừ đơn vị cách ly B5 không có trường hợp dương tính nào với virus SARS-CoV-2 kể từ ngày 1/10.

 Theo đó, ngày 17/10, Bộ y tế đã có công văn gửi UBND TP. Hà nội và UBND các tỉnh, thành phố đề nghị phối hợp với Bệnh viện Việt đức, đưa bệnh viện trở lại hoạt động khám, chữa bệnh bình thường trong tình hình mới kể từ 0g ngày 18/10.